Par décret du Président de la République en date du 25 avril 2017 et publié au Journal Officiel du 27 avril 2017, Pierre Thépot est nommé directeur général du centre hospitalier universitaire de Pointe à Pitre à compter du 8 mai 2017.
Il succède à Jean-Claude Pozzo Di Borgo, en poste d’août 2015 à mai 2017.

Après avoir été directeur du CH d’Aras (CHA), du CH de Moulins-Yzeure (Allier) en 2010, et élu en janvier 2016 à la présidence tournante de la Centrale d’achat de l’informatique hospitalière (CAIH), Pierre Thépot prend pour la première fois la direction générale d’un CHU. 

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