Le Pr Benoît Vallet est nommé directeur général de l’Agence régionale de santé (ARS) des Hauts-de-France, annonce le Gouvernement dans le compte rendu du Conseil des ministres du 28 septembre 2020. Il prendra ses fonctions à compter du 5 octobre 2020. Benoît Vallet remplace à ce poste Étienne Champion, nommé en septembre 2019 et qui avait annoncé son départ sur Twitter le 22 juillet, départ officialisé en Conseil des ministres le 9 septembre 2020.

Benoît Vallet, ex-directeur général de la santé de 2013 à 2018, a été nommé président du conseil d’administration de l’Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation (Anses) par décret du 10 septembre 2020, une fonction « non exécutive et non rémunérée » : il était jusqu’alors et depuis 2018 conseiller-maître à la Cour des Comptes, membre de la sixième chambre dédiée à la Sécurité sociale, à la santé et au secteur médico-social.

Médecin anesthésiste-réanimateur de formation, Benoît Vallet a réalisé en mars 2020 un audit des hôpitaux du Grand Est, région fortement touchée par le Covid-19, et participé en avril à la stratégie nationale de déconfinement, coordonnée par Jean Castex.