Jean-François Lefebvre succède à Marc Penaud, nommé à la tête du CHU de Toulouse en juin 2018, qui a été nommé inspecteur général des affaires sociales (Igas) par un décret de novembre 2021.
« Jean-François Lefebvre, directeur d’hôpital classe exceptionnelle, est nommé directeur général du centre hospitalier universitaire de Toulouse (Haute-Garonne) », annonce un décret du 7 janvier 2021 publié au Journal officiel (JO) du 8 janvier.

Une orientation marquée vers le numérique

Jean-François Lefebvre occupait jusqu’alors le poste de directeur général du CHU de Limoges (Haute-Vienne) depuis le 15 décembre 2015 : il assurait également les fonctions de président du GCS Nova, créé en avril 2021 par les trois CHU de Nouvelle-Aquitaine notamment pour développer le numérique en santé. Jean-François Lefebvre a aussi été jusqu’en 2020 président de la commission des systèmes d’information et de santé de la Conférence des directeurs de CHU.

Intervenu en novembre 2021 lors d’une conférence organisée par la Fédération Hospitalière de France dans le cadre de Santexpo, il avait évoqué l’idée de « structurer en France des centres de données cliniques qui bénéficieraient d’un financement pérenne » et de faire en sorte que ce réseau « puisse être construit en partenariat avec le Health Data Hub ».

Ancien élève de l’Ecole Nationale de Santé Publique (ENSP, aujourd’hui EHESP) , Il a notamment été directeur de l’évaluation, des finances et du système d’information et de Directeur de la recherche du CHU de Nîmes (de 1996 à 2000) : c’est à ce titre qu’il a reçu  le 1er Prix de l’Innovation Hospitalière avec le projet de télémédecine Maternet, avant de devenir directeur de la stratégie et des travaux du CHU de Nice (200-2007) puis directeur du Centre hospitalier de Cannes (2007-2015).